La unidad proporciona un Servicio de apoyo a la investigación al personal del IQM así como a otros centros del CSIC u organismos externos (Universidad, OPIs, Centros privados, etc).
En dicha unidad se dispone de un equipo de Resonancia de Plasmón de Superficie (SPR), que permite detectar y monitorizar interacciones entre dos o más moléculas en tiempo real mediante sensogramas y sin emplear ningún tipo de marcaje. Los estudios que pueden llevarse a cabo sirven para determinar la especificidad entre dos o más compuestos y/o para caracterizar la cinética y afinidad de dicha interacción. Con el análisis de los datos se obtienen las constantes de velocidad así como de asociación/disociación del complejo formado. Así mismo, también se emplea para estudiar interacciones a diferentes temperaturas, muy útil por ejemplo en la caracterización de mutantes proteicos.
Entre sus principales ventajas se encuentra su gran sensibilidad, fundamental en el caso de interacciones fármaco-diana. Los tipos de muestras que se pueden analizar en nuestro equipo incluyen desde biomoléculas (proteínas, péptidos, lípidos, etc) hasta fármacos, o compuestos orgánicos e inorgánicos.
Por otra parte, disponemos de un equipo de calorimetría de valoración isoterma (ITC). El ITC está dotado de un sistema de detección apto para trabajar con cualquier tipo de biomolécula y se basa en la absorción o desprendimiento de calor tras la interacción entre dos moléculas. Proporciona información acerca de la afinidad (Kd), entalpía, entropía y estequiometría de la reacción en un solo experimento y una de sus principales características es que el volumen que emplea para la celda es tan solo de 200 l. Permite trabajar con moléculas de bajo (fármacos) y alto peso molecular como proteínas, polisacáridos, lípidos, etc. Además, puede medir en diferentes medios y con pequeñas concentraciones de DMSO, imprescindible en el caso de interacciones con molécula pequeña. Por último, presenta una alta sensibilidad, ya que es capaz de medir interacciones débiles, así como realizar cinéticas.
Ambos equipos nos permiten estudiar las siguientes interacciones:
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- Interacciones fármaco-receptor
- Interacciones proteína-proteína, proteína-péptido o péptido-péptido
- Interacciones carbohidrato-proteína
- Interacciones lípido-proteína
- Interacciones enzima-sustrato
- Interacciones antígeno-anticuerpo
- Diseño de fármacos (caracterización de moléculas modificadas).
- Interacciones DNA-proteína o DNA-molécula pequeña.
Por último, la reciente adquisición de una nueva tecnología basada en fluorescencia intrínseca con incremento de la Tª (Nano DSF) nos permite conocer el perfil del estado plegado o desplegado es único para cada proteína, lo que nos proporciona la información necesaria para conocer la calidad de la muestra. Con este equipo se pueden determinar la funcionalidad de proteinas en presencia de sus ligandos, impurezas de la muestra y discrepancias entre dos lotes de la misma proteína. Además, discrimina entre los tampones más adecuados para la conservación de proteínas y establece sus condiciones de almacenamiento.