Ernesto Quesada del Sol se licenció en Ciencias Químicas (especialidad Química Orgánica) por la Universidad Autónoma de Madrid (UAM, 1990-1995). Obtuvo el grado de Doctor en Ciencias en el año 2000 (UAM) tras llevar a cabo la Tesis Doctoral conjuntamente en los Institutos de Química Orgánica General (IQOG) y de Química Física Rocasolano (IQFR) del CSIC (Dr. Francisco Amat-Guerri y Dr. Ulises Acuña). Durante este periodo realizó diferentes estancias predoctorales en la Université Louis Pasteur/CNRS en Strasbourg (Francia) (Prof. Guy Ourisson). A continuación, llevó a cabo un postdoctorado en el IQOG (2001-2002) (Prof. Serafín Valverde) y posteriormente otro en la University of York (Reino Unido, 2003-2005) (Prof. Richard J. K. Taylor).

En 2005 se incorporó al grupo de investigación Nucleósidos y análogos como fuente de moléculas bioactivas del Insituto de Química Médica CSIC (IQM) con un contrato JAE-DOC, obteniendo en 2007 la plaza de Científico Titular.

Su trayectoria ha abarcado desde la síntesis total de productos naturales hasta la metodología sintética, centrándose desde su incorporación al IQM en la obtención de moléculas con potencial actividad biológica dirigidas a la inhibición de la replicación de VIH.